Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPS1Q13098 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.4 ms