Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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NFIAQ12857 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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NFIAQ12857 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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NFIAQ12857 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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