Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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