Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TTPAP49638 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TTPAP49638 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTPAP49638 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTPAP49638 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms