Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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SNX13Q9Y5W8 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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SNX13Q9Y5W8 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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SNX13Q9Y5W8 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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SNX13Q9Y5W8 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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SNX13Q9Y5W8 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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SNX13Q9Y5W8 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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