Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms