Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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