Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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CITED1Q99966 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CITED1Q99966 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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CITED1Q99966 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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CITED1Q99966 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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CITED1Q99966 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CITED1Q99966 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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