Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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