Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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