Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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CHCHD4Q8N4Q1 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHCHD4Q8N4Q1 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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