Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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