Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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