Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FXNQ16595 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
FXNQ16595 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
FXNQ16595 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FXNQ16595 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FXNQ16595 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms