Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDB1Q16531 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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