Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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