Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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