Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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