Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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NEDD9Q14511 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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NEDD9Q14511 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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