Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE6HQ13956 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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PDE6HQ13956 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
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PDE6HQ13956 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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PDE6HQ13956 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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PDE6HQ13956 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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PDE6HQ13956 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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PDE6HQ13956 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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PDE6HQ13956 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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PDE6HQ13956 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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