Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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GTF2H2Q13888 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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GTF2H2Q13888 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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GTF2H2Q13888 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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