Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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