Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms