Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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