Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
XRCC4Q13426 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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