Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNTA1Q13424 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms