Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms