Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1AQ13111 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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