Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRDNQ13061 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms