Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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