Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms