Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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GTF3C1Q12789 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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GTF3C1Q12789 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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GTF3C1Q12789 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
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GTF3C1Q12789 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
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GTF3C1Q12789 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.1
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GTF3C1Q12789 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
GTF3C1Q12789 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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GTF3C1Q12789 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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