Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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