Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms