Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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