Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms