Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN16Q9Y5I7 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN16Q9Y5I7 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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