Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRXN1Q9ULB1 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NRXN1Q9ULB1 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms