Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKP4Q99569 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PKP4Q99569 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKP4Q99569 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms