Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms