Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

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Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNT1Q5JUK3 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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KCNT1Q5JUK3 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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KCNT1Q5JUK3 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNT1Q5JUK3 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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