Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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