Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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