Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms