Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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PTPRKQ15262 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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PTPRKQ15262 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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PTPRKQ15262 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRKQ15262 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
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