Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
EEA1Q15075 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms