Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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