Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SEMA3AQ14563 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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