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| SEMA3A | Q14563 | MTCO3P23-201 | ENST00000561363 | 289 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010620.2-201 | ENST00000600135 | 313 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | CYP3A43-217 | ENST00000631161 | 328 nt | TSL 5 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DCLRE1A-202 | ENST00000369305 | 4241 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| SEMA3A | Q14563 | THEMIS-201 | ENST00000368248 | 3866 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SHOC2-201 | ENST00000265277 | 3691 nt | TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ATP2B1-201 | ENST00000261173 | 6777 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| SEMA3A | Q14563 | THNSL1-201 | ENST00000376356 | 3691 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MS4A14-202 | ENST00000395001 | 3401 nt | TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RICTOR-201 | ENST00000296782 | 7505 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.158-201 | ENST00000363651 | 101 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP267-201 | ENST00000364893 | 126 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1318P-201 | ENST00000365389 | 103 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01545-201 | ENST00000377879 | 521 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.452-201 | ENST00000384202 | 108 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.557-201 | ENST00000384680 | 107 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AL360182.1-201 | ENST00000397433 | 468 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR888-201 | ENST00000401186 | 77 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MRPL42P3-201 | ENST00000401492 | 326 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP123-201 | ENST00000410732 | 291 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL589987.2-201 | ENST00000417426 | 582 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC114482.1-201 | ENST00000418010 | 247 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL109947.1-201 | ENST00000423747 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL445488.1-202 | ENST00000430623 | 545 nt | TSL 3 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091153.2-202 | ENST00000441700 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL354949.1-201 | ENST00000446438 | 170 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DCLRE1CP1-201 | ENST00000454630 | 470 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PLCXD2-AS1-201 | ENST00000493131 | 491 nt | TSL 3 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP217-201 | ENST00000515959 | 91 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.670-201 | ENST00000516255 | 105 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1069P-201 | ENST00000516612 | 133 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA31.19-201 | ENST00000517079 | 126 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC245166.1-201 | ENST00000521012 | 253 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-323P-201 | ENST00000521915 | 107 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HTN3-202 | ENST00000526767 | 578 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP002884.4-201 | ENST00000527589 | 594 nt | TSL 3 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP002004.1-207 | ENST00000531371 | 526 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SARNP-203 | ENST00000552080 | 726 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008269.2-201 | ENST00000561915 | 1105 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008739.2-201 | ENST00000597006 | 317 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | 7SK.7-201 | ENST00000603504 | 247 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR7112-201 | ENST00000616126 | 65 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PHF6-205 | ENST00000625464 | 4434 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FAM46D-201 | ENST00000308293 | 3011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CLOCK-201 | ENST00000309964 | 10304 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CDC27P3-201 | ENST00000635418 | 1910 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | USP45-208 | ENST00000500704 | 5826 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C1orf141-203 | ENST00000371007 | 2153 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR148B-201 | ENST00000362252 | 99 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA63.1-201 | ENST00000362493 | 131 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-525P-201 | ENST00000363685 | 104 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-884P-201 | ENST00000363889 | 107 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-270P-201 | ENST00000364131 | 105 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |