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| CAPRIN1 | Q14444 | DDX10P1-201 | ENST00000448545 | 1933 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | APCS-201 | ENST00000255040 | 926 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | Y_RNA.11-201 | ENST00000362375 | 109 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | U8.2-201 | ENST00000363156 | 134 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | Y_RNA.132-201 | ENST00000363421 | 102 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | RNU6-511P-201 | ENST00000363496 | 107 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | RNU6-1097P-201 | ENST00000363586 | 107 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CAPRIN1 | Q14444 | AC073308.1-201 | ENST00000623696 | 305 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | ATM-228 | ENST00000639240 | 498 nt | TSL 5 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CAPRIN1 | Q14444 | VPS54-202 | ENST00000354504 | 3594 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | CBLL1-201 | ENST00000222597 | 2003 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | ZBTB8OS-201 | ENST00000341885 | 312 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | Y_RNA.67-201 | ENST00000362870 | 100 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CAPRIN1 | Q14444 | TRAJ21-201 | ENST00000390516 | 55 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | RNU6-903P-201 | ENST00000391270 | 109 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | AL109755.1-201 | ENST00000401791 | 649 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |