Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CAPSQ13938 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPSQ13938 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms